| 1 | Vetterhöhle | Blaubeuren, Alb-Donau-Kreis | 18,754 m |
| 2 | Fuchslabyrinth | Schrozberg, Landkreis Schwäbisch Hall | 15,412 m |
| 3 | Hessenhaudoline | Berghülen, Alb-Donau-Kreis | 8,403 m |
| 4 | Wulfbachquellhöhle | Mühlheim an der Donau, Landkreis Tuttlingen | 6,699 m |
| 5 | Mordloch | Böhmenkirch, Landkreis Göppingen | 4,320 m |
| 6 | Falkensteiner Höhle | Grabenstetten, Landkreis Reutlingen | 3,987 m |
| 7 | Hohler Stein | Buchen (Odenwald), Neckar-Odenwald-Kreis | 3,000 m |
| 8 | Erdmannshöhle | Hasel, Landkreis Lörrach | 2,146 m |
| 9 | Friedrichshöhle | Hayingen, Landkreis Reutlingen | 1,331 m |
| 10 | Laichinger Tiefenhöhle | Laichingen, Alb-Donau-Kreis | 1,300 m |
| 11 | Nebelhöhle | Lichtenstein, Landkreis Reutlingen | 830 m |
| 12 | Eberstadter Tropfsteinhöhle | Buchen (Odenwald), Neckar-Odenwald-Kreis | 645 m |
| 13 | Charlottenhöhle | Giengen an der Brenz, Landkreis Heidenheim | 587 m |
| 14 | Sontheimer Höhle | Heroldstatt, Alb-Donau-Kreis | 530 m |
| 15 | Todsburger Schacht | Mühlhausen im Täle, Landkreis Göppingen | 500 m |
| 16 | Kolbinger Höhle | Fridingen an der Donau, Landkreis Tuttlingen | 330 m |
| 17 | Karls- und Bärenhöhle | Sonnenbühl, Landkreis Reutlingen | 292 m |
| 18 | Amandahöhle | Beuron, Landkreis Sigmaringen | 275 m |
| 19 | Schillerhöhle | Bad Urach, Landkreis Reutlingen | 245 m |
| 20 | Schertelshöhle | Westerheim, Alb-Donau-Kreis | 212 m |
| 21 | Rainloch | Mühlacker, Enzkreis | 200 m |
| 22 | Gutenberger Höhle | Lenningen, Landkreis Esslingen | 180 m |
| 23 | Kornäckerhöhle | Buchen (Odenwald), Neckar-Odenwald-Kreis | 180 m |
| 24 | Olga-Höhle | Lichtenstein, Landkreis Reutlingen | 170 m |
| 25 | Todsburger Höhlen | Mühlhausen im Täle, Landkreis Göppingen | 130 m |
| 26 | Eichbergschacht | Sonnenbühl, Landkreis Reutlingen | 120 m |
| 27 | Mondmilchhöhle | Lenningen, Landkreis Esslingen | 112 m |
| 28 | Teufelsloch Rheinfelden | Rheinfelden (Baden), Landkreis Lörrach | 105 m |
| 29 | Gussmannshöhle | Lenningen, Landkreis Esslingen | 91 m |
| 30 | Heimensteinhöhle | Neidlingen, Landkreis Esslingen | 80 m |
| 31 | Scheunenhöhle | Beuron, Landkreis Sigmaringen | 73 m |
| 32 | Gönningers Höhle | Dettingen an der Erms, Landkreis Reutlingen | 68 m |
| 33 | Kahlensteinhöhle | Bad Überkingen, Landkreis Göppingen | 66 m |
| 34 | Bittelschießer Höhle | Bingen, Landkreis Sigmaringen | 64 m |
| 35 | Kreenheinstetter Höhle | Beuron, Landkreis Sigmaringen | 61 m |
| 36 | Steinernes Haus | Westerheim, Alb-Donau-Kreis | 50 m |
| 37 | Roßberghöhlen | Sonnenbühl, Landkreis Reutlingen | 45 m |
| 38 | Eichberghöhlen | Sonnenbühl, Landkreis Reutlingen | 40 m |
| 39 | Vogelherdhöhle | Niederstotzingen, Landkreis Heidenheim | 40 m |
| 40 | Eulengrube | Sigmaringen, Landkreis Sigmaringen | 38 m |
| 41 | Birkelhöhle | Heidenheim an der Brenz, Landkreis Heidenheim | 36 m |
| 42 | Kobelhöhle | Burladingen, Zollernalbkreis | 35 m |
| 43 | Willmandinger Bröller | Sonnenbühl, Landkreis Reutlingen | 32 m |
| 44 | Veronikahöhle | Lenningen, Landkreis Esslingen | 31 m |
| 45 | Wassersteinhöhle | Bad Urach, Landkreis Reutlingen | 31 m |
| 46 | Fohlenloch | Gammertingen, Landkreis Sigmaringen | 30 m |
| 47 | Ramensteinhöhle | Nattheim, Landkreis Heidenheim | 30 m |
| 48 | Zwiefaltendorfer Tropfsteinhöhle | Riedlingen, Landkreis Biberach | 27 m |
| 49 | Roßgallenschacht | Lenningen, Landkreis Esslingen | 26 m |
| 50 | Stellenwaldhöhle | Lichtenstein, Landkreis Reutlingen | 24 m |
| 51 | Öschinger Klufthöhle | Mössingen, Landkreis Tübingen | 20 m |
| 52 | Sommerkirchhöhle | Burladingen, Zollernalbkreis | 12 m |
| 53 | Schwedenhöhlen | Obermarchtal, Alb-Donau-Kreis | 10 m |
| 54 | Götzenloch | Ruppertshofen, Ostalbkreis | 6 m |
| 55 | Anhäuser Tuffhöhle | Schwäbisch Hall, Landkreis Schwäbisch Hall | 5 m |
| 56 | Benediktushöhle | Beuron, Landkreis Sigmaringen | 5 m |
| 57 | Moosmannshöhle | Lauterbach, Landkreis Rottweil | 5 m |