| 1 | Cueva de Peñamiel | Nieva de Cameros, Rioja, La | 1419,57 m |
| 2 | Cueva Halcón | Mansilla de la Sierra, Rioja, La | 1213,10 m |
| 3 | Cueva Mina Marte | Ezcaray, Rioja, La | 970,70 m |
| 4 | Sima de San Bartolomé o El Maestro | Nestares, Rioja, La | 609 m |
| 5 | Sima de San León | Ábalos, Rioja, La | 528 m |
| 6 | Cueva del Tejón | Ortigosa de Cameros, Rioja, La | 460 m |
| 7 | Cueva Lóbrega | Torrecilla en Cameros, Rioja, La | 455,20 m |
| 8 | Cueva - Mina de la Serrezuela | Agoncillo, Rioja, La | 377 m |
| 9 | Cueva Calera | Villavelayo, Rioja, La | 368 m |
| 10 | Cueva Río Portilla I | Mansilla de la Sierra, Rioja, La | 363,42 m |
| 11 | Cueva de San Martín | Santa Engracia del Jubera, Rioja, La | 351 m |
| 12 | Cueva de la Paz | Ortigosa de Cameros, Rioja, La | 236 m |
| 13 | Sima de Velasco | Ezcaray, Rioja, La | 221 m |
| 14 | Sima del Castillo | Santa Engracia del Jubera, Rioja, La | 220 m |
| 15 | Cueva de la Perla | Pradillo, Rioja, La | 192 m |
| 16 | Cueva Río Portilla VII | Mansilla de la Sierra, Rioja, La | 176,82 m |
| 17 | Cueva Negra | Pradillo, Rioja, La | 161 m |
| 18 | Sima de Martín | Nieva de Cameros, Rioja, La | 154 m |
| 19 | Cueva de las Tres Ventanas | Arnedillo, Rioja, La | 147 m |
| 20 | Cueva eremítica Los Palomares | Nalda, Rioja, La | 143,16 m |
| 21 | Cova Nuña | Brieva de Cameros, Rioja, La | 138 m |
| 22 | Cueva - Sima del Tesoro | Foncea, Rioja, La | 138 m |
| 23 | Cueva de los Siete Lagos | Aguilar del Río Alhama, Rioja, La | 134 m |
| 24 | Cueva de Peñasmalas | Pradillo, Rioja, La | 134 m |
| 25 | Cueva RJ 3 | Santa Engracia del Jubera, Rioja, La | 134 m |
| 26 | Cueva Surgencia I 1 | Almarza de Cameros, Rioja, La | 133,34 m |
| 27 | Cueva de Peñamiel Baja II | Nieva de Cameros, Rioja, La | 125 m |
| 28 | Sima de San Cristóbal | El Rasillo de Cameros, Rioja, La | 121,40 m |
| 29 | Cueva Jubera 2 | Santa Engracia del Jubera, Rioja, La | 118 m |
| 30 | Cueva del Diablo | Pradillo, Rioja, La | 116 m |
| 31 | Cueva de Pepe Botella | Nieva de Cameros, Rioja, La | 114 m |
| 32 | Cueva de la Viña | Ortigosa de Cameros, Rioja, La | 113,40 m |
| 33 | Sima del Valiente | Préjano, Rioja, La | 113 m |
| 34 | Sima del Maño | Nestares, Rioja, La | 111 m |
| 35 | Cueva de Cerrauco | El Rasillo de Cameros, Rioja, La | 105 m |
| 36 | Cueva de las Cabras | Pradillo, Rioja, La | 103 m |
| 37 | Cueva Nuño I o Trónvalos | Anguiano, Rioja, La | 103 m |
| 38 | Sima de la Lastra | Santa Engracia del Jubera, Rioja, La | 99 m |
| 39 | Sima de la Encineta | Arnedillo, Rioja, La | 98 m |
| 40 | Cueva la Escondida PL - 1 | Lagunilla del Jubera, Rioja, La | 97,99 m |
| 41 | Cueva Viniegra 3 | Viniegra de Abajo, Rioja, La | 97 m |
| 42 | Cueva Iregua 6 | Pinillos, Rioja, La | 95,40 m |
| 43 | Cueva de los Grajos | Villavelayo, Rioja, La | 92 m |
| 44 | Sima Sancirian | Viguera, Rioja, La | 91,57 m |
| 45 | Cueva de las Escalerillas | Brieva de Cameros, Rioja, La | 91 m |
| 46 | Cueva la Bien Aparecida | Brieva de Cameros, Rioja, La | 91 m |
| 47 | Cueva PN 1 - PJ 2 | Préjano, Rioja, La | 85 m |
| 48 | Sima I 4 La Hoya | Nalda, Rioja, La | 83,70 m |
| 49 | Cueva del Puente | Anguiano, Rioja, La | 79,60 m |
| 50 | Cueva de los Moros | Valgañón, Rioja, La | 79 m |
| 51 | Cueva Mori, More o Miraflores | Anguiano, Rioja, La | 73 m |
| 52 | Cueva PN 5 | Pinillos, Rioja, La | 70,20 m |
| 53 | Cueva de La Cerilla | Brieva de Cameros, Rioja, La | 69 m |
| 54 | Cueva de la Tajadita | Ortigosa de Cameros, Rioja, La | 67,50 m |
| 55 | Cueva de la Macarosa | Anguiano, Rioja, La | 67 m |
| 56 | Sima de las Cabezuelas | Nieva de Cameros, Rioja, La | 65,90 m |
| 57 | Sima del Sendero | Santa Engracia del Jubera, Rioja, La | 65 m |
| 58 | Cueva de Valleluenga | Nieva de Cameros, Rioja, La | 64 m |
| 59 | Cueva de Peña Otaza (Mario) | Cellorigo, Rioja, La | 61,21 m |
| 60 | Cueva de la Zura | Pradillo, Rioja, La | 60,50 m |
| 61 | Cueva de las Cuatro Puertas | Arnedillo, Rioja, La | 60 m |
| 62 | Sima de Bocarana (La Tolacha) | Galbárruli, Rioja, La | 60 m |
| 63 | Cueva de Santiago | Viniegra de Abajo, Rioja, La | 58 m |
| 64 | Sima la Raja | Nestares, Rioja, La | 56 m |
| 65 | Cueva del Tragaluz | Ezcaray, Rioja, La | 55,80 m |
| 66 | Cueva eremítica Monacato de Garona grupo II | Leza de Río Leza, Rioja, La | 55 m |
| 67 | Cueva de Jorge o de San Jorge | Nieva de Cameros, Rioja, La | 54 m |
| 68 | Cueva Viniegra 6 | Viniegra de Abajo, Rioja, La | 53 m |
| 69 | Cueva Río Portilla IX | Mansilla de la Sierra, Rioja, La | 51 m |
| 70 | Cueva del Carbón | Préjano, Rioja, La | 50 m |
| 71 | Cueva Río Portilla VIII | Mansilla de la Sierra, Rioja, La | 50 m |
| 72 | Sima el Pico | Anguiano, Rioja, La | 50 m |
| 73 | Cueva Innominada de Jorge | Nieva de Cameros, Rioja, La | 49 m |
| 74 | Cueva de los Murciélagos | Préjano, Rioja, La | 48,40 m |
| 75 | Sima Lucas | Lagunilla del Jubera, Rioja, La | 48 m |
| 76 | Sima de los Llanos | Cellorigo, Rioja, La | 45 m |
| 77 | Cueva de La Rótula | Pradillo, Rioja, La | 43 m |
| 78 | Cueva Iregua 10 | Torrecilla en Cameros, Rioja, La | 43 m |
| 79 | Cueva Arroyo Castejón IV | Nieva de Cameros, Rioja, La | 42,60 m |
| 80 | Cueva de Admuel | Almarza de Cameros, Rioja, La | 42,50 m |
| 81 | Cueva de las Mujeres | Ortigosa de Cameros, Rioja, La | 41,15 m |
| 82 | Cueva de los Quiquillos | Santa Engracia del Jubera, Rioja, La | 40,50 m |
| 83 | Sima Lucía | Viniegra de Abajo, Rioja, La | 40,30 m |
| 84 | Cueva Iregua 9 | Torrecilla en Cameros, Rioja, La | 40 m |
| 85 | Cueva Arroyo Castejón III | Nieva de Cameros, Rioja, La | 38,35 m |
| 86 | Cueva de Peñamiel Alta I | Nieva de Cameros, Rioja, La | 38 m |
| 87 | Cueva - Sima del Arco | Anguiano, Rioja, La | 38 m |
| 88 | Cueva de Pradillo | Pradillo, Rioja, La | 37,60 m |
| 89 | Cueva Iregua 5 | Nieva de Cameros, Rioja, La | 37 m |
| 90 | Cueva Arroyo Castejón | Nieva de Cameros, Rioja, La | 36,70 m |
| 91 | Sima el Caracol | Anguiano, Rioja, La | 36 m |
| 92 | Cueva RJ 9 | Santa Engracia del Jubera, Rioja, La | 35,50 m |
| 93 | Cueva Gonzalo | Brieva de Cameros, Rioja, La | 35 m |
| 94 | Sima Maestro 90 | Ventrosa, Rioja, La | 34,50 m |
| 95 | Sima I 3 | Viguera, Rioja, La | 33,70 m |
| 96 | Cueva Cobarajas 1 | Villavelayo, Rioja, La | 32 m |
| 97 | Cueva Garona I | Leza de Río Leza, Rioja, La | 30,80 m |
| 98 | Cueva Río Portilla II | Mansilla de la Sierra, Rioja, La | 30,64 m |
| 99 | Cueva de la Rubia o Peñarrubia | Viniegra de Arriba, Rioja, La | 30,40 m |
| 100 | Cueva de las Hojas | Pradillo, Rioja, La | 30,40 m |